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SSR/STR分子標記服務
目錄號:FZ-3 規格:詢價

微衛星其串聯重復性的核心序列為1~6 bp,其中最常見的是二核苷酸重復,如:(CA)n ,每個微衛星的核心序列結構相同,重復單位數為10~60個,其高度多態性來源于串聯重復單位數的不同。由于微衛星兩端的序列一般是保守的,因此可以通過微衛星的側翼序列設計引物,通過PCR擴增出長度不同的PCR片段,將PCR產物進行凝膠電泳,根據分離片段的大小決定基因型。





   

 技術路線

 


 

 

 

SSR實驗服務常見問題解答

1)公司可以做哪幾種熒光標記的檢測?

    我們采用ABI3730X Genetic Analyzer  對擴增片段進行毛細管電泳檢測,采用ROX500

作為分子量分析內標(紅色),PCR引物可以標記藍色(FAM)、綠色(HEX)、

黃色(NED),客戶只需提供引物序列,我們負責熒光引物的合成,同時根據擴增

片段的長度,設計引物組合、標記顏色組合,對多個位點復合擴增,同時檢測,以

便低成本高效的給客戶完成實驗。

 

2)SSR相關收費標準?

    按照實驗完整度,分以下幾種:

a.客戶提供提供相關實驗位點信息,我們完成整個實驗,其中包括引物篩選及后續全

部試驗,收費為:20元/反應(不包括引物合成費),熒光引物的合成300元/對(包

括上下游引物,熒光引物只標記其中一條)。b .客戶按照標記要求,送來的熒光引

物擴增后的PCR產物,收費為900元/板(96個樣,包括內標價格)。c .對于多個位點同

時檢測,如:4個位點,混合上樣,我們考慮到數據分析工作,每增加一個位點多100

元,即:4個位點,在原有基礎上增加了3個位點,共1200元。

 

3)是否可以提供全部檢測的峰圖?

    我們可以提供部分檢測峰圖,如:每個位點檢測到的等位基因對應的峰圖,因為

同一等位基因峰圖基本一致,所以不一一提供。

 

4)除了原始數據,一些常見遺傳多樣性分析參數是否可以提供?

    我們可以提供各位點檢測到的等位基因,等位基因頻率、多態信息含量(PIC)、期

望雜合度、觀察雜合度等常見的一些遺傳學參數。

 

5)對于一些未發表STR位點的物種,是否可以進行引物開發?

    對于未發表STR位點的物種,我們一般通過兩種方法進行STR引物的開發。第一,

從已發表的的近緣物種的SSR位點中篩選,多態性高,特異性好的SSR位點。但一般

特異性不好。第二,我們通過磁珠富集法篩選開發SSR引物,該方法篩選的引物物種

特異性較好,但實驗周期會長一些。

 

6)是否可以做SSR片段的回收克隆、測序?

     我們可以做STR的回收克隆測序,具體價格可協商。

 

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參考資料

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